timsTOF flex产品横幅

timsTOF-fleX上的MALDI引导的SpatialOMx

马尔代夫-2:带来了增强的灵敏度和维度

timsTOF fleX现在提供了创新而强大的MALDI-2技术选项。这种后电离技术不仅显著提高了离子产量,而且降低了离子抑制效应,与传统的MALDI实验相比,信号增加了1-3个数量级。对于MALDI成像实验来说,这种提高的效率意味着每像素检测到的分子数量增加了一倍以上,从而大大改善了生理环境。

图1:示意图 图1:示意图
图1:示意图

增加灵敏度> 100x:扩大化学范围

通过减少离子抑制效应电离更大范围的化合物类

MALDI-2技术使您的MALDI成像研究具有无与伦比的灵敏度和绘制更多化合物的能力。基于激光的后电离增强了对许多类生物分子的检测,这些生物分子在传统的MALDI实验中通常不会电离。MALDI-2在MALDI成像中也增加了对目标分析物的敏感性,特别是通过提高离子产量和降低离子抑制效应。

图2:脑组织中上调的化合物
图2:脑组织中上调的化合物

MALDI-2,引领医药组织模型革命

在现代药物研发的一个主要限制因素是使用其之前的分析和定量用LC-MS研究均质器官和组织的“搅拌良好的模式”。这种方法非常适合向靶器官内提供的药物和代谢物精确量,但与试图描述的药物化合物的生理效应病理学方法不容易兼容。MALDI成像已经在组织查明的药物和代谢产物的确切位置作出对血浆组织模型的转化显著的影响。MALDI-2通过提高整体灵敏度能够定量为更广泛的剂量水平的提高为制药研究分子成像。此外,各种通过MALDI-2中看到的分子类型的增加扩展成像于涉及两个异生素和内源分子有更多的项目制药的适用性。

图4:剂量组织的药物成像(氯喹)
图4:剂量组织的药物成像(氯喹)

MALDI-2,引领医药组织模型革命

timsTOF fleX上的MALDI-2

图3:肝脏匀浆稀释系列中发现的药物
图3:肝脏匀浆稀释系列中发现的药物

TIMS和MALDI-2:OMICS上下文深度内容成像

涉及从组织切片解吸小分子如脂质组学和代谢组学研究OMICS通常涉及从各种各样的化学种类的生物分子。These studies benefit from MALDI-2 as the technique provides access to many more compounds, providing unique insight into nature’s complexity.. The combination of TIMS and MALDI-2 is uniquely powerful as richer ion yields from the post-ionization process produce mass spectra with higher information content. TIMS provides fast orthogonal separation that efficiently unravels these complex spectra where each m/z can contain many overlapping features. The result is not only the ability to extract information from single isobars, but also exact masses that have different ion mobilities. Collisional Cross Section (CCS) values are recorded for each one of the spectral components for comparison to databases or LC/MS results.

图5:MALDI-2和TIMS
图5:MALDI-2和TIMS

万博在线客服Bruker提供了完整的解决方案

万博在线客服Bruker提供了执行成功的MALDI-2实验所需的所有元素,包括必要的矩阵和IntelliSlides、专家应用程序支持以及直观和用户友好的软件解决方案。

摘要

  • MALDI-2使人们能够进入MALDI中通常容易受到离子抑制的化学类
  • 灵敏度比MALDI提高2-3个数量级,取决于样品、矩阵和分析物
  • 不需要更改物理硬件,只需在软件中单击一下即可在MALDI和MALDI-2之间切换
  • 用户友好的软件解决方案,简单的仪器校准和应用科学家测试方法开始测量立即
  • 易于使用的消耗品可提供完整的解决方案

肿瘤不仅仅是眼睛看到的

癌症的微环境包含健康细胞、肿瘤细胞、结缔组织、血管和炎症在不同时间点以不同比例的组合。这些组分中的每一个都有自己独特的化合物分子特征。研究疾病状态的研究人员在很大程度上依赖于对组织病理学的解释,并在生物分子的背景下创建这些地图,以弥合传统组学与理解疾病之间的鸿沟。

高潮2019新闻稿

SpatialOMx——发现生物标志物的关键

癌细胞和其他疾病状态具有显著的遗传和表观遗传修饰,影响基因组表达级联。无论你是在观察蛋白质组、类脂组还是代谢组,化合物的空间分布都包含有助于理解样品的宝贵信息。如果某些化合物在空间上高度集中,或者分子在特定结构上共同分布,那么当只检查均匀化的样品时,这一重要信息就会丢失。基于组学的生物标记物发现可能会受到限制,因为组织级通信网络是癌症生长不可或缺的组成部分,因此没有空间信息来添加重要的上下文线索。

2降雨量
timsTOF-fleX上获取的大鼠脑脂质图像。在20μm空间分辨率下测量,包含312095个光谱,采集时间为5小时。下面板显示了SCiLS实验室从该数据集生成的分割分析。光谱被聚类到对应于不同大脑区域的区域。

为X-Omics分析引入空间维度

timsTOF fleX是一种多功能仪器,用于探测样品的分子含量。timsTOF fleX建立在Bruker最早的timsTOF Pro平台上,是一款全功能高速、高灵敏度的ESI仪器,可用于所有X-OMI万博在线客服C分析,结合高空间分辨率的MALDI源和阶段,专门用于解析分子分布,并将空间维度带到组学分析。把蛋白质组学转化为空间蛋白质组学,把脂质体学转化为空间脂质体组学,把代谢组学转化为空间代谢组学。

SpatialOMx工作流
SpatialOMx工作流(单击放大)

创建你自己的复杂互动地图

绘制复杂的分子网络图揭示了细胞内网络中相互作用分子的复杂系统。使用SpatialOMx创建具有洞察力的通信机制图谱意味着了解更多有关细胞相互通信以支持变化的方式的信息:

  • 细胞如何与本地微环境互动,以制定促进和调解程序
  • 特定细胞的分子网络如何相互作用以发挥特定的生物学功能
  • 表观遗传修饰对这些网络有什么影响。

timsTOF fleX——在空间代谢组学、空间脂质组学或空间蛋白质组学之间轻松切换的灵活性。

瑞克·德雷克

Richard R.Drake教授,美国南卡罗来纳医科大学蛋白质组学中心主任

“timsTOF fleX是一种创新工具,它可以协同多种分析能力,以允许开发新的omics工作流。对于成像MS,它可能具有潜在的转化性,特别是对于组织代谢组学和糖组学应用。”

结合世界上最快的蛋白质组学仪器和超过25年的MALDI经验

将PASEF驱动的LC-MS/MS识别与无标签空间定位相匹配,以解码样本的分子组成

timsTOF fleX基于shotgun蛋白质组学标准,将最佳的4D x组学与Bruker的最先进的MALDI成像技术结合在一起,包括用于快速测量的SmartBeam 3D激光光学。万博在线客服timsTOF fleX是一种非常适合SpatialOMx的双源仪器,它可以进行强大的ESI测量,并在一个平台上直接解决组织中的大量分子。在此之前,还没有一种仪器能够为最先进的组学研究人员提供这两种基本能力。

柔性支架原理图
柔性支架原理图

从4D组学到分子成像,不间断、不改变、不修改、不妥协

SpatialOMx要求PASEF启用LC-MS/MS进行深度4D组学,并结合MALDI成像创建组织切片分子图像的能力。为了在一个平台上做到这一点,布鲁克的工程师们从获奖的TIMS双万博在线客服级离子漏斗开始,并结合了靶级和rapifleX轴向TOF仪器的激光元件。在运行过程中,SmartBeam 3D激光器的软件激活是源区唯一的变化。没有复杂的转换意味着在生产力上零妥协,并且能够毫不费力地从世界级的组学鉴定和量化工作流转移到创建组织切片的高清晰度分子图,以了解什么是最重要的。

由于MALDI和ESI产生的离子从源到探测器的路径相同,MALDI工作流程可以利用timsTOF Pro中发现的最先进的特性,包括基于被检测分子碰撞截面的TIMS离子迁移率分离和高速高灵敏度PASEF碎裂。可在ESI模式下进行调谐和校准,并用于MALDI实验,以增加优化的便利性。

用MALDI成像直接从组织中提取分子图谱

MALDI成像是一个无标签的工具,用于检查分子的分布直接从薄组织切片。MALDI成像可用于检查广泛的分析物,包括代谢物、脂质或聚糖,并与显微镜工作流程无缝兼容,可以为空间omx分析识别区域特定的化合物分布。使用Br万博在线客服uker的IntelliSlides在timsTOF flex上实现自动的MALDI成像和SpatialOMx工作流。

TIMS消除了脂质成像中的等压干扰
TIMS消除了脂质成像中的等压干扰。
蓝色:m/z 762.6+/-0.016;黑色。1.45±0.012
黄色:m/z 762.6+/-0.016;黑色。1.48±0.015

缩放模式,看看什么是真正重要的

除了能够生成高清晰度的“真实像素”MALDI图像外,SmartBeam 3D激光源还利用Bruker的新变焦模式技术,提供低至10微米的固体激光制导瞄准。用户现在可以根据感兴趣的生物特征灵活地调整激光光斑大小和间距,以适应更大的粒度范围。万博在线客服

小鼠视网膜
在变焦模式下,小鼠视网膜的脂质测量为10焦/秒。刻度条表示100刷新m
(图片由范德比尔特大学质谱研究中心博士Jeffrey Spraggins提供)

结合X-Omics性能和高MALDI灵敏度

timsTOF fleX唯一支持SpatialOMx

无论是蛋白质组学、类脂组学、糖组学还是代谢组学,timsTOF-fleX都是进行深层空间分析的理想平台。使用专利SmartBeam™ 利用3D技术进行快速、无标签的MALDI成像,绘制样本中分子的分布图,并识别感兴趣的区域,以便进行更具体的分析。应用PASEF供电LC-MS/MS为了最高水平的鉴定和对你的结果的最大信心。

在器官功能的差异反映在他们表达的蛋白质的差异
在器官功能的差异反映在他们表达的蛋白质的差异

快速、高灵敏度的生物标志物发现

结合捕获离子迁移度光谱法(TIMS)和并行累积串行碎片(PASEF)在美国,timsTOF fleX可以从少量高度复杂的混合物中提供定量信息。使用小于200ng的样品负荷和90分钟的梯度长度,可以从一个典型的人类细胞系裂解液中识别出超过5400个蛋白质组。高灵敏度降低了样品制备成本,减少了维护时间损失。

研究化合物分布的MALDI成像

利用现有的脂组学、代谢组学或糖组学协议,MALDI成像光谱可以用作特定区域的分子指纹,或者研究化合物如何在整个样品中定位以发现生物标记物。这也可用于研究化合物的时间变化、定量以及与组织状态的相关性。timsTOF fleX允许快速高质量分辨率的MALDI成像-使用SmartBeam 3D和专用的MALDI源和阶段,从包含370000像素的大鼠脑切片中高空间分辨率测量脂质需要不到5小时。

MALDI引导空间omx激光精确效率

对小组织切片(<100μM)进行取样的传统工作流程为各种化学类别(包括RNA/DNA、蛋白质、聚糖、脂质和代谢物)提供了深入的分子细节。然而,处理时间长,组织切除位置由缺少分子信号信息的光学图像决定。timsTOF fleX上的SpatialOMx快速提供了一个高清晰度、无标签的概述,将化学信息与重要的形态学背景相结合。手动选择您感兴趣的区域,或使用启用SCiLS的自动分段,以准确地知道提取将产生最大影响的位置。

介绍SpatialOMx的自动分子注释工作流

使用Bruk万博在线客服er行业领先的软件,现在可以直接从组织中注释目标分子。只需将数据加载到SCiLS实验室,定义感兴趣的区域,并将峰值列表导出到MetaboScape。使用数据库或LC-MS/MS分析中的复合列表注释峰值,然后检查并将注释导出到SCiLS以进行可视化。通过SCiLS,您可以使用路径和熟悉的术语可视化结果,而不是大量标签,以减少从数据到结果的时间。

图1
新的质谱成像流程:组织中代谢物和脂质的自动标注。
*脂质图和HMDB不是Bruker产品。万博在线客服

智能幻灯片™ -利用智能最大化每个像素的信息内容

IntelliSlides是专门为简化MALDI成像工作流程而设计的,它是跨样本映射分子的最佳工具。你不费吹灰之力就取得了前所未有的成绩。

简化MALDI成像实验

IntelliSlides是MALDI成像的理想样本目标。潜在的低效率的来源是消除了永久性铭文在导电表面。这些铭文通过帮助追踪样本和指示放置组织样本的位置,简化了用户体验。总是正确的标记,总是正确的方向,智能简化了你的结果的方式。

非常适合SpatialOMx

在timsTOF fleX上的SpatialOMx工作流程中,MALDI成像用于绘制组织切片上的分子分布,从而识别感兴趣的区域,并将x组学分析聚焦于特定细胞群。有了IntelliSlides和专门的软件,在timsTOF fleX上的图像注册过程可以通过点击一个按钮自动完成。使用timsTOF fleX激光光学快速对齐目标样本,通过IntelliSlides将工作流程设置缩短至3分钟,允许您更快速、准确地将化学信息匹配到每个像素。

兼容组织学

IntelliSlides与标准显微镜载玻片尺寸相同,并与常见的组织学染色和程序兼容,如苏木精和伊红。有了永久性的铭文,就不用再担心注册标记(也称为“教标记”)会在组织学溶剂中溶解,从而使测量后染色组织更容易与相应的MALDI数据集进行共同注册。

特点和IntelliSlides的好处

  • 满足可靠MALDI电离的所有要求
  • 导电滑面上的所有文字
  • 永久注册标记(示教标记)指示在哪里放置样品并用于MALDI仪器内对准
  • 独特的序列号和条形码,简化样品跟踪
  • 使用fleXimaging 5.1及更高版本设置的自动图像采集
  • 与组织学和显微镜技术兼容
  • IntelliSlides是一种避免潜在污染源的一次性消耗品
IntelliSlides
总时间取决于教案面貌和个人
用户体验/能力(5到30分钟)

仅供研究使用。不用于临床诊断程序。